一个与当今世界类似的世界。
不过，这个世界上存在着一种被称为“精灵”的高智慧生命体与人类共存。
精灵从何时开始存在、又是何时与人类走上不同进化道路的？
为何会有人类与精灵两种智慧生命体同时存在？
研究这个谜团的学问被称为“精灵学”。
主角霧原拓真的父亲霧原龍太郎是大学中研究精灵学的教授，也是这个领域的创始人。
而在这对父子两的家中，有一位精灵女性与他们同居。
她的名字叫ソフィア・アルディス・フェアグリン。
龍太郎作为精灵学的研究者，与精灵有着频繁的交流，
因此拓真与ソフィア从小就一起玩耍一起长大。
根据ソフィア父亲的建议，为让ソフィア协助人类的研究，
ソフィア成为了龍太郎的研究会的特别临时讲师，并入籍其大学成为研究样本，每天也去大学学习。
ソフィア与拓真一同长大，亲如姐弟，不过随着两人的成长，这份感情发生了变化。
两人开始意识到对方是异性的事实。
在一个屋檐下生活至今，并未从两小无猜的关系中前行一步。
某天，龍太郎需要去海外发表研究成果。
孤男寡女在家的两人，确认了两人之间的关系，终于成为了恋人。
坠入幸福之中的两人万万没想到。
有个黑影正在逼近他们。
一个将这对天真烂漫的恋人撕开的故事正在展开。
