自从在全世界确认了拥有魔力的女性、即“魔女”的存在，早已过了多少年月。
“魔法”完全融入了日常生活，“魔法仅限于女性所有”成为了世界的常识。
但是，颠覆常识的一名少年被得以确认——
这名少年東雲蒼，身上带着“世界上唯一拥有魔力的男性”的轰动头衔，
入读了魔女们的学校、国立御久仁学園。
日本国内的学生们聚集的东学舍塔，其管理者是“东学舍塔学生会”。
来自海外的留学生们聚集的西学舍塔，其管理者是“西学舍塔学生会”。
存在着这样2座塔与2个学生会，就是这么一间有点奇怪的学校。
作为学校里唯一的男性，一开始七上八下畏首畏脚的蒼的担心很快就化解了，积极地开始了快乐明亮的校园生活！
——还没松一口气，马上又与刚刚结识的朋友们一起，几乎是强制性地被逼参加东塔学生会，
在匆匆忙忙之间向学生会监察会、通称魔法学生会大战发起挑战。
东塔与西塔两个学生会将代表各自的塔、通过各种竞技进行激烈较量的这场大赛，可是赌上了塔的威信。
面临不容许失败的蒼，心里有一样担心——
「就算要我参加所谓的魔法学生会大战，可是我不会使用魔法的啊……」
蒼的魔力非常微量。而且还是没有属性的无色魔力。
不能如同魔女们将魔力以魔法的形式使用的他，充其量只不过是个有着超特异体能的普通男学生而已。
怀着不安与期待，跟满眼皆是的魔法少女之间的校园生活，呈现出心跳加快兴奋雀跃的多彩的百花缭乱的恋爱模样。
在各种意义上自然地成为了事件的中心的蒼，能在这个满是魔女的学校、还有魔法学生会大战的前方得到什么呢——
