自古以来，在日本就存在着两大神明，最高神的天照御神，和象征邪恶的荒祭神。 善与恶，幸福与不幸，生与死——天照御神与荒祭神所带来的一切都体现在人类自身上。 其中，荒祭神会时不时现世，给人类带来负面影响，令世间乱成一团。 本游戏的主角黑鸟由弦是东京都的一名公务员，他所属的部门正是位于都厅7层的荒祭神应对科。 荒祭神应对科聚集着能够看到并且有力量对抗荒祭神的成员。成员选拔方法据说多种多样，然而最终测试都一样，就是以能不能看得到代代木钟塔顶上的巨大花朵为准。 黑鸟在这里已经工作了3年。 今天的东京也充满着荒祭神的气息——…。
天照はこの国の最高神として、アラマツリはこの国の 悪しき力を象徴するものとして古来から存在している。
善と悪、幸福と不幸、生と死――天照とアラマツリに由来するそれらは全て 人間に内包されている。
アラマツリは時に具現化し、時に人間に悪影響を及ぼして世間を騒がせる。
主人公である黒鳥由弦は都庁に働く公務員である。 所属は都庁７階に存在するアラマツリ対策課。
アラマツリを見、対抗できる人間達が集まった部署であり、 その選抜方法は様々だが、最後は代々木の時計塔の上にある巨大な花を見ることが出来るか、であった。
黒鳥が所属してから３年。
東京は今日も変わらずアラマツリが漂っている――……。
