2012年，夏。
就读于东京美术专门学校的主人公百日紅一二三，受邀协助町兴志愿活动，与朋友们一同前往自己的故乡葛折町。
这座城镇中流传着几则传说。
当地有供奉古老器物的风俗，而那些器物被称为九十九神，是神——也是妖。
它们会给予人恩惠，作为代价则吞食人的心（记忆）与命（寿命）。
并且，被九十九神附身的人，会在百年一度的“欠け月”之夜，与九十九神一同被带往常世……
这些传说既是民话，也是传承……对一二三而言，本应只是遥远世界里的童话。
抵达葛折町的夜晚，一二三遇见了一名少女。
那是一个全身缠着绷带、令人毛骨悚然的少女……少女将“九十九神・白蛇精”的形代交给一二三，而那形代具现化成大蛇，袭向了一二三。
少女如此告知他。「那个九十九神一直在等你……等待实现愿望、成为依代的你。甚至思慕到想要附身并杀死你的程度……呵呵」
背对残缺的红月——“欠け月”，少女诡异地笑着。
在被逼入绝境的一二三面前，出现的是另一名少女的身影——手持手枪九十九神・八房的那名少女，名为伏姫。
一二三与伏姫，两人的相遇就此拉开故事序幕。
人与器物，以及妖的故事被编织而成。那是欠け月之夜的夜想曲……
