拥有研究者父亲的主人公・佐伯和史,与同为研究者且交情深厚的 神代、桜井家有着宛如家人般的交流。其中与神代琴音、桜井優美,因为年纪相仿且身为单亲的父亲经常不在家,从小就像对待亲姐姐、亲妹妹一样对待她们,度过了平稳的日子。 然而,那样的日子会因为突然的事故而被夺走。 由于在海外调查中发生的原因不明的事故,参加调查团的 神代、桜井的双亲丧生,同行的琴音虽然保住了一命,但就在那之后便下落不明了…… ——那之后第三年的夏天。 和史将失去的悲伤藏在心中,与依然经常不在家的父亲和失去双亲的優美一起过着新的生活。多亏了身为同班同学也是损友的松島徹,和史他们逐渐找回了平稳的日子。在这样的情况下,因为与转入和史班级的女孩・霧島晶的相遇,和史的学园生活突然变得热闹起来。 然而与此同时,和史的周围开始发生了不可解的事件……


