《PrismRhythm》的故事发生在遥远的未来世界，由于过去发生的战争和环境污染，人类文明一度面临消失的危险。不过100年前，世界各地出现了一种名为“春雪”（スプリングスノー）的大树，它具有净化水的能力，人类借此恢复文明，重新获得了和平的生活。从此，人们就怀着对春雪力量的敬意度过每一天。
男主角土岐远一骑住在名为艾尔（アイレ），分为7个街区的小岛上，小岛中央的山顶便有一棵高大的春雪。在人们向春雪献上名为“アルガロ・デ・モンド祭”感谢的那个夜晚，他为了验证祖父那里听来的妖精传说，偷偷潜入到小岛中心的森林里，在森林中遇见了凯洛琳·玛莉葛。在和她交谈后，土岐远一骑决定参与圣伯蒂娜学院（聖ベルティナ学院）的入学考试，他历经难关考入了这所学校，与一群想要为春雪献上祝福的舞女们开始了新的生活。
