第1话「女孩遇见男孩」妹妹篇
失去双亲后，与年长许多的哥哥相依为命的朝仓晶乃(朝倉晶乃)。
之后，晶乃被伯母夫妇收养，但哥哥总一郎(総一郎)却丢下她前往美国留学了。 在亲戚们的反对声中，晶乃体谅启程的哥哥的心情，笑着送走了他……但至今仍时常会想。
——那时候，是不是应该把自己真正的心意告诉哥哥才对……
故事从几年后开始，晶乃为了和总一郎一起生活，来到了乡下小镇津川。转入哥哥工作的箱实科技谷的学校后，晶乃在那里与青梅竹马的杉田宗亲、高柳肯重逢了。两人似乎在和哥哥进行一项极机密的研究，但其内容并没有向晶乃透露。
然而有一天，出于一次偶然，晶乃得知了他们开发的“自律机动车辆伊兹娜”的存在……
