“这个世界正面临着各种各样的毁灭。” 从这句话开始的，是将世界从毁灭中拯救出来的战斗。 与同伴一起重复了无数次的毁灭时间，终于将世界从毁灭的命运中守护了下来。 在那场战斗的中心——龙护寺，原本就住在这里的刻乃等人，以及统果、克罗娜(コロナ)、缪丽尔(ミュリアル)等也照旧生活在这里。 此外，被救出的赤也加入了进来，一如既往地继续着喧闹的日子。 一边与回归原本生活的智明等队伍的三人，以及龙一、明日翔等协助者保持联系，一边处理偶尔送上门的关于魔物与灵异现象的委托，就这样度过了时光。
就这样，大约过了一年。 刻乃和茜从皇河学园毕业，其他人也都各自顺利地升了级。 某一天，曾一同与毁灭命运战斗的论说部部长云母，通过米德尔斯坦联系了龙护寺。 说是“我要休一段时间的假，能不能让我在龙护寺住一段时间呢”。 在之前的事件中没能好好道谢的统果等人，爽快地答应了这件事。 统果等人满心期待着论说部的到来，但论说部的众人却没有在龙护寺出现。
然后，在流星降临的夜晚，故事开始转动。 传来了仿佛陨石坠落般骇人的巨响，前往那个地方一看，发现有一个遍体鳞伤的少女，和一个身受濒死重伤的少年。 有什么事情要开始发生了。统果渐渐有了这样的预感——
