遥远的天之国的神明，栖息在我们人类生活的这片大地上的神明。 风火地水，寄宿于自然中的诸神。 道具变化而成的付丧神，以及动物与人的灵魂被供奉而成为神明的灵魂。 这个国家自太古时代起，就存在着许多神明。 而如今，在这个时代。就在我们人类的身边……有着为了守护我们而诞生的，全新的神明。 被称为人类智慧结晶的人工神。 ──我们人类，终于也凭借自己的双手创造出神明了。
在夏日的暑气尚未消退之时，搬回自幼生长的白葵町的主人公 香月紗結（氏名変更可）与年龄相差悬殊的哥哥・ 香月湊
“虽然只是隐约记得，但我感觉自己还记得这里的街景……”
怀着怀念的心情走在街上的紗結。 她因为双亲亡故的打击，过去的记忆变得模糊不清了。 虽然也有不安，但与温柔的哥哥相互扶持生活着的紗結，着眼于珍贵的现在与未来，并没有勉强自己去回想过去的记忆。
紗結转入这里已经1周。 已经完全习惯了这座小镇和学园的某一天。 白葵学園来了一名转校生。
他径直走到紗結身边──
“终于见到你了……。我是花葵神社的‘人工神’！为了取回我的力量，需要你失去的记忆！ 求你了！和我一起寻找吧” 自称是‘人工神’的不可思议的青年 香月蓮 告诉她，他在幼年时与紗結相遇，并封印了‘紗結的记忆’与‘蓮作为神明的力量’。
空白的记忆 ──
寻找失去的记忆碎片的故事，现在，开始了……。
