——日本还没经过产业革命，还是个没实现现代化的和如今不同的世界。
文久三年。
守护了长达300年的幕藩体制的德川幕府，正面临着列强逼迫开国、蓄意恢复朝廷权利的势力，外様藩的计策，内忧外患和体制崩坏的双重打击。
政权之争的舞台由江户转移到京都，豪杰奸臣，所有一切的阴谋都向帝都聚集。
在这档口上，在被任命为京都守护的松平容保的发动下，
瘴姫――由全是接受了鬼瘴石洗礼的女人组成的治安维持组织“新撰組”成立了。
鬼瘴石一旦附身于相性贴合的人，就会使她的臂力、反射神经得到加强，获得如同鬼神一般的战斗力。
但天意弄人，这种能力只在女人身上才会体现。
在多摩的某个农村，担任剣術道場・試衛館塾頭的俊英・沖田惣次郎，是个独来独往的人。
敬重道场主近藤伊佐，然后是救自己于危难之中的伊佐的结拜兄弟・土方歳如同家人和主人般，直到得知要募集在幕府任职京都守护的“瘴姫”的通知。
立刻被伊佐叫来的惣次郎，得知了两人要去京都的消息。
既然作为瘴姫活着，就要肩负起相应的责任——这点惣次郎也很明白。
但是，惣次郎还没有机会给两人报恩或者还情。这是一个心结。
但接下来从伊佐那边听到的话使惣次郎很惊讶。
「现在能用你的天稟剣，为我们效劳吗」
让惣次郎也辅佐去京都——伊佐告知道。
