相当于前作Novel游戏版『斬魔大聖デモンベイン』的后日谈的故事。 因为Demonbane的活跃邪神的阴谋被打破，历史得到了修正。 这个世界里不再存在犯罪组织『黑魔术结社』，完成了使命的Demonbane也消失了行踪。然而在ArkhamCity，怪异事件仍然在连续发生，Dr.West卷起了骚动。既为大黄金时代亦为大混乱时代还为大暗黑时代――ArkhamCity的本质完全没有改变。 主人公大十字九郎与他的同伴アル・アジフ作为专门解决怪异事件的魔导侦探活跃着。怪异的黑影再次迫近二人。
「毛贼……在这Miskatonic大学秘密图书馆里有何贵干？」
某夜，贼人侵入了补完禁断的魔导书的Miskatonic大学的秘密图书馆。贼人穿越图书馆长ヘンリー・アーミティッジ的防线，夺走那本魔导书『Necronomicon』，消失了行踪。 那是卷入ArkhamCity的怪异事件的开端。
