历史悠久的港口小镇，合志。 这里自古便有与鲸鱼交流的传统，过去也曾有过信仰鲸鱼的文化。 “村民若是作恶，鲸神便会伴随风暴出现，将陆地上的事物吞噬殆尽”，这一传说流传至今。 到了夏天，供奉这位鲸神的神社会举办名为鲸波祭的祭典，作为祭典活动的木筏竞速每年都会引发热潮。 为了在木筏竞速中夺冠，主人公海原一海（うなばらかずみ）、朋友矶波胜男（いそなみかつお）以及胜男的妹妹若音（わかね）三人，在矶波家拥有的岛屿上制作木筏。 然而，如同风暴般的台风接连不断，三人不得不暂时中断木筏的制作。 台风过后，三人前来查看木筏的情况，映入眼帘的是损坏的木筏和满是垃圾的海滩。
在那些漂流物中，有一名少女……。
因台风漂流到岛上、失去记忆的少女“鲸（くじら）” 她除了自己的名字外什么都不记得了。三人暂且决定照顾鲸。 她究竟是什么人？与合志的传说有关联吗。 与鲸那有些不可思议的共同生活就此开始。 三人借助各种帮助，逐渐逼近合志的信仰与鲸的真实身份。 前方的真相究竟为何。 与不可思议少女的相遇，为三人与合志的港口带来了异想天开的夏日两周。
