「在这里放弃？还是——为了改变而行动？」
大约500年前，5颗陨石接近地球，引发了被称为“五大流星雨”的大灾害，随后冬之时代到来。
人类迁往地下、海底，以及被称为アーコロジー的建筑物之中，等待地球环境再生。
——外面是人类无法居住的不毛之地。
不知从何时起，居住在和平箱庭般的アーコロジー中的人们，逐渐失去了对那片不毛之地的兴趣，将其视作只存在于知识与记录中的遥远场所。
舞台是保留着昔日被称为日本之地浓厚文化色彩的日系アーコロジー“天原”。
住在那里青年・日高千尋，以天原发展出的机动竞技“フライト”的王者・織倉練児为师，坚信总有一天自己也能与师父一同飞翔，并持续训练。
然而，他所憧憬的英雄織倉練児，某一天因事故身亡。
千尋虽然知道那起事故部分原因，却也背负着巨大的心理创伤，从フライト的世界中脱离。
失去了“天空”的千尋，怀抱着焦躁感，没有目的，也没有目标，甚至怀疑着活着的意义，只是凭惰性度过每一天。
某一天，在这样的千尋面前，一架从未见过的フライト机体撞破天空之壁坠落下来。千尋赶向迫降的机体，并与乘坐其中的金发少女相遇。
「这里不是天堂吧。因为，要是连天堂也有墙的话，那也太讨厌了。」
被墙壁与天花板包围的封闭都市・天原。
和平的箱庭，然而也是停滞不前的这座城市中的相遇。
以这一天为界，千尋以及他周围停滞的日常与关系，开始运转起来——。
