Shu在一家披萨店工作。在他送外卖的路上，他看到梦想成为声优的Nagi在河边练习。在他返回餐厅的路上，他再次看到了Nagi，但他们卷入了一场卡车事故中，双双失去了生命……
他们来到了一所位于这个世界与那个世界之间的学校，名为“Conservatory”。他们醒来后发现，有一种方法可以回到这个世界。必须赢得一场一对一的音乐比赛。这意味着胜者可以回去，而败者不能。讽刺的是，Shu将要与实际上是音痴的Nagi进行一对一的比赛……Shu建议他们在比赛日之前一起练习……
除了占据游戏大部分的冒险部分外，Dear Pianissimo还包含了音乐序列。在这些序列中，玩家需要在正确的时机按下键盘上的按键，为当前的歌曲伴奏。如果玩家不想参与，这些序列可以设置为自动。
