在《绫波育成计划》，玩家会扮演一名刚刚被分配到第三新东京市的NERV成员（名字由玩家决定），阶级为三尉。在会见指挥官碇源堂后，他被指派去照顾第一适任者——神秘的EVA驾驶员绫波丽，任期为2015年4月1日至2016年3月31日（“人类补完计划”发动日），包含了整个《EVA》系列动画以及剧场版《Air/真心为你》中的情节。 2003年12月11日，该游戏的PS2版本《新世纪福音战士：绫波育成计划与明日香补完计划》（新世紀エヴァンゲリオン 綾波育成計画 with アスカ補完計画）发布。PS2版本除了拥有原版中的绫波丽路线，还可以解开一个新的明日香路线，此路线有异于原著发展（甚至会得到战胜SEELE及战略自卫队的if结局。）
愉快的挖老碇墙角吧（？）
