——21XX年，春。
由于激进派女权主义的跋扈，日本已成为完全的女性优势社会。 根据数十年前成立的“男女隔离法”，男子在出生后立即被隔离在收容所， 为了应对长期的战争，将被作为士兵培养。 野蛮的男人们被排除在外，世道正是女性之女性为女性的社会，少女们的理想乡！
但是，在这样的世界里仅有一人，有一个隐瞒性别生活的少年。 原本是防卫军少年兵的他，因为某件事情在边境的村落隐瞒户籍被窝藏，与义母义妹一起和平地生活着。 这样的他，由于社会管理AI「マザー」的指示，被召集到女性一方的武装组织「保安隊」的训练学校，故事由此开始。
与志愿跟随而来的义妹一起初次见到的都市，虽说已衰退却仍是华丽的少女之园。 隐瞒性别前往保安隊附属女子学园上学的他，以成为宿舍同室为契机，遇到了心地善良的少女「アカリ」。 也受前辈们的照顾，在严格却又有些快乐的训练生活中，少年逐渐与少女变得亲密，甚至萌生了恋慕之心。
但是不能忘记的是，这个世界对男人很严酷的现实。 甚至存在呼吁灭绝男性的激进派的社会。 如果他是男人这一事实暴露的话，不知道会遭遇怎样的对待。 实际上，本应是温柔少女的她，也能面带微笑地说出口。
“梦想是，把男人赶尽杀绝！”
